肾囊肿痛主要是由两种原因引起：

　　一、肾囊肿较大，早期肾囊肿患者囊肿面积较小，往往不会出现胀痛，但若不及时治疗囊肿会逐渐增大，直径越来越大，会出现压迫症状，患者感到疼痛。

　　二、肾囊肿合并有感染，长期肾囊肿合并有感染，如肾囊肿破溃、破裂出血，甚至腹膜出血，合并有尿路感染、结石，这些并发症发作时会出现腹部疼痛、排尿时疼痛，甚至肾绞痛、疼痛剧烈等情况。