甲亢主要会影响到代谢系统、心血管系统。对于代谢系统的影响主要是代谢旺盛，出现体温偏高，能量消耗增加，诱发怕热、多汗、消瘦等症状，严重可出现营养不良，同时血糖水平也有不同程度的升高。对于心血管系统的影响，主要是和甲亢时交感神经兴奋相关，因为肾上腺素水平升高或引起心率增加、血压升高，长时间的心率增快，可以诱发甲亢性心脏病，血压增高则以收缩压增高为主，诱发收缩期的高血压。另外，因为代谢增加和交管神经兴奋的增加，可以间接影响到精神系统，有的人会出现易怒等精神方面的改变。如果出现眶周细胞的浸润水肿，则会出现甲亢性突眼导致视力下降。