头疼可以选择做CT，也可以选择做核磁共振。临床引起头疼的原因有很多，例如脑血管病变、脑肿瘤以及颅内感染、退行性病变、外伤等，也包括高血压、低血压、贫血，甚至颈椎病变，CT和核磁共振都属于比较先进的医疗检查设备。

　　但核磁共振的检查分辨率相对更高，对大脑的情况看得更清楚一些，但是其检查预约相对会慢一些，因各个城市医院的配置情况不同而不同。