小腿肌肉疼主要的原因包括以下几方面：

　　第一、最为常见的是剧烈运动或者跑步、跳动引起肌肉产生大量乳酸，从而引起的肌肉酸痛，此情况比较多见。

　　第二、不除外是由于动脉血栓形成后导致供血不足，引起小腿肌肉缺血、缺氧，从而诱发疼痛。

　　第三、由于腰椎管疾病，包括腰椎狭窄、腰间盘突出压迫神经导致。

　　因此，建议患者及时到正规的医院进行检查，积极查找原因。