对于儿童鹅口疮的根治不需要静脉用抗真菌药或者口服抗真菌药。需要用湿棉签粘干的制霉菌素粉，口腔内局部涂抹抗真菌药，每天两到三次，这种方法效果比较明显。建议持续涂抹制霉菌素，直到鹅口疮消失后再涂三到五天，以防止鹅口疮复发。同时，可以口服益生菌以纠正肠道菌群失调，抑制真菌生长。预防的主要措施是注意平时的卫生，可以加强营养，适当的口服维生素B2和维生素C。