三个月宝宝如果出现睡觉摇头要考虑以下因素：首先是宝宝维生素d摄入不足引起佝偻病，会导致出汗增多，同时还会伴有夜间容易惊醒和枕秃，严重会出现方颅、鸡胸等症状。如果宝宝有头部湿疹，睡觉时和床面摩擦也会引起不适，表现为频繁摇头。如果宝宝患有中耳炎，除摇头外还会用手抓挠耳朵，出现异常烦躁，需要带宝宝及时到五官科进行相关检查并治疗。