两岁宝宝发烧40度的时候，可以服用比较温和的退热药物，如布洛芬等。如果体温持续不退，应该及时送到医院，然后在专科医生的指导下采取有效的处理措施。

　　此外，两岁宝宝发烧40度的时候需要完善血象、血培养、胸片等检查明确病因。如果是细菌感染导致的发烧，应该根据血培养和药敏的结果合理使用抗菌药物进行治疗。如果是受凉感冒导致的高烧，可以服用中成药进行治疗，如板蓝根颗粒。