眼睛里面长了痘痘应该通过以下方法进行治疗：
第一、对于眼皮内部有疼痛感的痘痘，考虑是麦粒肿造成，可以涂抗生素眼膏治疗，常用的有氧氟沙星眼膏、红霉素眼膏、妥布霉素眼膏等。

　　第二、眼皮内部无痛性痘痘考虑是霰粒肿造成，可以进行热敷治疗。

　　第三、白眼球表面的痘痘考虑是由于结膜淋巴液囊肿所致，需要先通过热敷治疗促进消退，效果不佳时可以采取手术切除。