药物流产不干净主要处理可参见以下几点：

　　第一、先进行超声检查，抽血测HCG等相关检测，以了解宫内残留多还是少，如果残留物过多，同时患者有出现阴道持续性多量流血现象，建议在超声检查下行清宫术，另外还需要注意预防感染处理。如果残留物较少，而且患者没有出现阴道出血情况，血HCG值在正常范围内，这种情况下可暂时先观察，有可能患者在下次月经来潮时少许残留物会伴随着经血排出。

　　第二、如果检查过程中发现残留物紧贴于子宫壁上，建议先不要盲目行清宫术，必要情况下，还需行宫腔镜下残留物清除，因此对于药流流不干净情况需要具体情况具体分析。