阿奇霉素主要的副作用是胃肠道刺激比较严重，患者应用后出现恶心、呕吐，甚至腹痛。有部分人群会出现皮疹和血管神经性水肿。

　　阿奇霉素会刺激胃肠道蠕动增强，而导致腹泻，静脉点滴阿奇霉素浓度过高，会刺激性脉血管疼痛、红肿，阿奇霉素主要经过肝脏代谢，长期应用会导致肝功能异常、转氨酶增高，有肝功能异常者不要应用阿奇霉素。