怀孕40天孕囊大小直径在1至1.5厘米左右。怀孕40天有的人可以看到卵黄囊，偶尔也可以看到胎心搏动。孕囊在怀孕早期每天增长0.1厘米左右，在怀孕六至七周在超声下可以看到胎心胎芽。如果怀孕40天还看不到孕囊或者是孕囊发育小，根据月经周期、同房日期或孕早期HCG，推算胚胎发育是否正常。