月经结束第三天同房，有可能怀孕，因为女性在月经结束之后是否是安全期，跟月经周期有关，跟月经持续的时间也有关。如果月经周期是30天左右来一次，从月经第一天算，包括月经期，八天之内是安全期。如果月经持续已经达到七天，月经结束第三天已经不是安全期，虽然有怀孕几率，但不会太高，但是如果平时月经周期是比较短的只有25天，月经结束第三天已经到排卵期，不仅会怀孕，而且几率比较高。