畸胎瘤手术后卵巢位置隐隐疼可能是手术刺激、炎症感染、组织粘连等原因引起的，建议对因治疗。

1、手术刺激：畸胎瘤手术时会对局部造成一定的损伤，当手术结束之后就会出现卵巢位置隐隐疼的现象，通常属于正常的生理反应。注意多休息，保证充足的睡眠即可缓解疼痛。

2、炎症感染：如果手术之后受到细菌感染造成盆腔炎，也可能会导致卵巢位置隐隐疼。通常可以在医生的指导下使用头孢、阿莫西林等药物治疗。

3、组织粘连：畸胎瘤手术之后在恢复的过程中，纤维结缔组织可能会把不同部位的组织粘连在一起，而出现卵巢位置隐隐疼。部分患者随着组织的恢复粘连情况会消失，如果粘连情况过于严重，通常需要采取手术的方法将其剥离。