右侧附件区囊肿是否会影响怀孕，要看附件区囊肿性质以及大小。一般右侧附件区囊肿是做彩超时发现，大多数没有自觉症状，多为生理性，比如增大的卵泡或黄素囊肿，不会影响生育。通常增大的卵泡会随着排卵结束消失，与月经周期有一定的关系。黄素囊肿大多数是妊娠早期出现，会随着妊娠月份增大消失。

　　如果是浆液性囊肿或是粘液性囊肿，可能是病理性囊肿，有的甚至要手术后，才能确定囊肿性质。还有一种囊肿是巧克力囊肿，也就是子宫内膜异位症造成。这些囊肿可能对生育造成不良影响，特别是囊肿超过五厘米以上，应该尽早手术，避免出现囊肿扭转破裂，影响受孕以及孕期发生不良情况。