因为新生儿坏死性小肠结肠炎只发生于有病的新生儿中间，健康的足月儿一般不会发生，早产儿发生新生儿坏死性小肠结肠炎与早产儿自身的生理特点有关，一是早产儿的肠道功能不成熟，肠道蠕动较差，肠腔内容易积留食物残渣。

　　二是早产儿肠道屏障功能较差，且肠道内益生菌的定值较差，以上综合因素导致早产儿容易发生新生儿坏死性小肠结肠炎，同时肠黏膜的缺血缺氧，也容易引起新生儿坏死性小肠结肠炎。

　　妊高症的母亲以及宫内窒息缺氧的孩子生后，容易发生新生儿坏死性小肠结肠炎，另外肠道的感染，包括全身感染和颅内感染也可以引起新生儿坏死性小肠结肠炎。肠道微生态环境的失衡以及喂高渗透压的配方奶和药物都可以增加新生儿坏死性小肠结肠炎的发病风险。