一、发病的病原体不一样。病毒性结膜炎是由于病毒感染引起的。而细菌性结膜炎是由于细菌性感染引起的。

　　二、临床表现不一样。虽然都会出现红肿、热痛、烧灼感、异物感，但略有差别，病毒性结膜炎患者的眼部分泌物，往往比较稀薄，属于水样分泌物，而且分泌物较多。而细菌性结膜炎分泌物往往比较黏稠的，有时会出现白色黏稠分泌物。

　　其次两种结膜炎的发病急缓往往不一样，病毒性的结膜炎发病较急，通常在感染之后，一两天之间就会发作。