CT相比较于核磁共振辐射是明显增大的。核磁共振没有任何的电离辐射，而CT却是依据X线成像的原理形成图像，所以CT是有辐射性的；另外，CT的辐射的范围基本都控制在正常的情况下，一般在短时间内进行CT的检查都会有一定的辐射损害。

　　此外，在怀孕的期间是不能进行CT检查的，容易导致胎儿畸形的发生。核磁共振是依据人体细胞内清理磁核，在强大的磁场空间内产生共振运动，经过一系列重建的技术转换为图像，是没有辐射的。