扁平疣的治疗方法有很多，通常情况下可以外用五氟尿嘧啶乳膏、维a酸乳膏、干扰素凝胶或者咪喹莫特乳膏治疗，治疗的时候需要注意不要损伤周围正常的皮肤。

　　目前有一种比较新的治疗方法，光动力治疗，治疗效果比较好，复发的几率比较小，只是价格相对较贵。也可以冷冻或者二氧化碳激光治疗。