肛门镜检查，是发现肛肠疾病的主要手段。在检查时，会在上面涂石蜡油，以确保能顺利进入痔直肠。插入肛门镜时，会顺着腹部一侧方向进入，然后再向尾骨移动。为了观察的完整，检查时需要转动肛门镜，动作必须轻柔，以免损伤被检查者的肠道。

　　肛门镜能检查的疾病很多。直肠病变，就可以通过肛门镜检查出来。不管是有炎症，还是有穿孔，都可以观察到。这些情况，不仅会引起黏膜充血，也会导致黏液分泌增多，还会引起糜烂状改变。这些变化都是诊断的依据，还可以了解病变的位置。

　　肛管病变，也能通过肛门镜检查发现。长内痔时，肛管上会有明显的静脉团出现，也可能是长条状的。内痔出血的话，就能看到静脉团附近有充血的情况，颜色有异常。肛门镜也能查出内痔的体积大小，是否有脱出的可能性，为治疗提供依据。

　　肛门镜也能初步查出肿瘤。长肿瘤时，黏膜组织会有异常改变，黏液蛋白明显增多。病变的位置，和周围的组织连接不清晰，有向周围侵犯的倾向。肿瘤的大小也能观察到，还可以刮取组织，进行化验。