小便时尿道刺痛常见病因如下：一、急性膀胱炎，急性膀胱炎患者由于尿液中有大量炎症细胞，在解小便时，炎症细胞刺激尿道会引起尿道刺痛不适，一般使用消炎药治疗，选择头孢类或者喹诺酮类。

　　二、尿道炎，尿道炎患者尿道会有刺痒感，而且尿道口一般会有白色分泌物流出。此疾病一般会取白色分泌物做培养，根据培养结果选择合适消炎药进行治疗。