怀孕12周有褐色分泌物一般是不正常的，建议患者入院明确病因。

怀孕12周属于怀孕早期，此时胚胎发育不是特别的稳定，而且此时也属于胚胎发育的关键阶段。怀孕12周时一般不会产生褐色的分泌物，如果有褐色分泌物可能是先兆流产、胎盘位置低，或者患有阴道炎等原因引起。建议孕妇减少活动量，尽快到医院检查，明确病因，针对性治疗。

在怀孕期间要多住观察自身及胎儿情况，并定时产检，以便出现异常问题医生可以尽早采取相应的治疗措施。