新生儿大便最后有血丝可能与便秘、新生儿出血症、肠道感染等有关，具体处理与病因有关。

1、便秘：可出现大便干结以及排便时哭闹，血丝在大便表面，而且还可能出现肛门便后滴血的情况，建议适当按摩腹部，促进排便，也可以在医师指导下使用肠道益生菌调节肠道功能。

2、新生儿出血症：新生儿肝脏合成凝血功能比较差，而且母乳中凝血因子含量比较少，尤其是维生素K1，容易导致出血，可能会出现皮肤出血、肚脐出血等，建议在医师指导下使用维生素K1进行治疗。出血严重时，需要输注血浆。

3、肠道感染：新生儿免疫功能低下，肠道黏膜屏障功能还没发育成熟，容易受到致病菌入侵，导致血管破裂出血，会有大便次数增多、性状改变，甚至出现脓血便，建议进行大便常规等检查。若有细菌感染，建议在医师指导下使用抗生素进行治疗。

此外，还需要警惕肠道坏死、肿瘤等。