真菌性肺炎疗程约2-4周左右，需要根据病情严重程度决定具体治疗疗程。

真菌性肺炎是由曲霉菌、念珠菌、隐球菌等真菌感染的肺炎，真菌性肺炎患者炎症感染位置偏深，病菌相对更加顽固，属于一种病程较长的肺炎类型，目前临床上抗真菌的药物至少需要2-4周左右，才能达到消除真菌的效果，部分体弱多病患者治疗疗程可能需要更长时间，需根据具体病情严重程度而定。

真菌性肺炎治疗周期长主要是因为抗真菌药物容易发生耐药性，故而出现反复感染的现象，患者应遵医嘱坚持用药，治疗彻底。