青少年膝关节疼痛的原因有不恰当运动、缺钙、骨关节炎等，要及时配合医生做治疗。

1、不恰当运动：青少年不恰当运动，引起了软组织损伤，会伴有膝关节疼痛感。需要通过按摩或者热敷的方法缓解症状。

2、缺钙：青少年如果缺钙引起了骨骼结构改变，会伴有疼痛症状，要配合医生，通过碳酸钙片、乳酸钙片、葡萄糖酸钙口服液等药物治疗。

3、骨关节炎：青少年如果存在风湿性关节炎，可能会导致膝关节有疼痛感，可以配合医生通过来氟米特胶囊、甲氨蝶呤胶囊、塞来昔布胶囊等药物治疗。

除了以上原因以外，也有可能是骨折等。要配合医生做治疗。