新生儿大便频繁但又不是腹泻的的原因主要考虑与胃肠道尚未发育健全有关。

新生儿出生后可因为胃弯尚未形成致使胃部储存食物的能力比较弱，同时新生儿的肠道较短，对于肠内容物的消化吸收能力较差。上述因素的存在容易导致吃进去的食物在胃肠道的蠕动作用下被快速排出体外，从而可出现大便次数增多但又不是腹泻这种症状。

另外，宝宝胃肠道内的消化酶分泌量较少以及胃肠道不规律性蠕动等因素也可引发上述症状。随着新生儿的生长发育这种症状多可自行消失，一般不建议进行特殊治疗。