跑步膝盖上方疼可能是因为劳累过度、软组织损伤、肌肉拉伤等，要及时采取针对性处理。

1、过度运动：过度运动会导致局部有乳酸沉积，从而可出现疼痛症状，通过休息、热敷，症状会逐渐的改善。

2、软组织损伤：跑步期间如果导致了膝盖软组织损伤，那么在跑步的过程中就会出现膝盖的拉扯性疼痛。建议患者休息，疼痛严重时需对膝关节制动，疼痛严重时可遵医嘱服用依托考昔、对乙酰氨基酚、塞来昔布等消炎止痛药物；必要时可考虑手术。

3、肌肉拉伤：在跑步期间如果姿势不正确，引起了肌肉拉伤，会伴有疼痛的症状。建议患者多休息，早期可以对局部进行冰敷，也可配合医生通过使用洛索洛芬钠、双氯芬酸钠、布洛芬等药物止痛。

除了以上原因以外，也有可能是骨关节炎等疾病导致的，建议患者入院就医检查治疗。