囊肿一般情况下是不会影响怀孕的，但是囊肿的大小程度不一样，生长的位置也可能会不同，如果囊肿比较大尽量做完手术后再怀孕。囊肿是因为长时间受到炎症感染引起的，如果功能性卵巢囊肿不是特别严重，没有明显的体征和症状，不会影响到正常怀孕，随着时间推移囊肿可能会自动消失，但是囊肿比较大不会自己消失，即便不会影响到怀孕，会降低怀孕的几率，怀孕之后也可能会伴随着有早产或者是流产的状况。女性出现囊肿后尽量先到医院接受治疗，等到身体的状况恢复正常之后再选择怀孕。