归脾丸和健脾丸主要是药物的成分有明显的不同，功效有所不同，治疗疾病有所不同。1.成分不同：归脾丸里面的成分主要是党参、白术以及远志等，健脾丸里面的成分主要是人参、木香、黄连和陈皮等。2.功效不同：归脾丸能够达到比较好的益气健脾以及补血安神的功效，健脾丸主要达到比较好的健脾开胃以及消食止泻的功效。3.治疗疾病不同：归脾丸一般可以应用于心脾气血两虚所引起的面色苍白，肢体麻木，健脾丸主要应用于脾胃功能不好所引起的腹痛，腹胀。