手指甲凹凸不平有小坑很可能是长时间挑食偏食、体内缺钙等因素所引起。长时间挑食偏食、营养不良可能就会导致身体上面的营养元素大量的流失，会导致指甲的颜色发生明显的改变，指甲一点也不光滑，导致指甲上面产生凹凸不平的小坑。缺钙的情况下，也有可能会影响指甲的营养，引起指甲发生明显的改变。正常人的指甲颜色是粉红色的，表面光滑润泽，指甲出现异常，说明身体处在亚健康的状态。