霉菌性阴道炎和滴虫性阴道炎最大的区别是致病菌和感染后的症状有所不同。霉菌性阴道炎感染后，会出现阴道分泌物颜色为乳白色或是白色豆腐渣样、白带会增多、不伴有异味、外阴会出现瘙痒难忍，持续时间长。滴虫性阴道炎症状会出现白带异常，呈黄绿色或是灰黄色，有异味，并且容易导致尿路感染等。滴虫性阴道炎和霉菌性阴道炎都可以通过白带常规检查进行区别。