新生儿肺炎可分为早发行或晚发行，主要病原菌是细菌早发现肺炎一般发生于出生后的48小时内，自出生后的六天以内都可能，早发型肺炎主要是由于从母体中获得。比如从被感染的羊水或病原菌通过胎盘从母体传给胎儿，晚发现肺炎可能发生在住院期间或出院后通常由于细菌或病毒在新生儿住院时定植，或在月内从被感染的个体或从被污染的器械中获得，微生物可以通过损伤的器官或支气管黏膜或者经血侵入。