乙肝第三针晚打了两个月可能会影响到乙肝疫苗的效果，而且会导致乙肝抗体的形成下降，可能需要重新接种乙肝疫苗，是第三针乙肝疫苗是用来加强乙肝抗体的，如果体内没有检测到乙肝抗体就需要重新接种疫苗。正常情况下，乙肝疫苗是在孩子出生的时候就需要接种的，但是成年人也是需要接种乙肝疫苗的，如果成年人没有接种过乙肝疫苗，可以选择在身体健康的条件下进行乙肝疫苗注射，乙肝疫苗注射分成三针，第一针跟第二针隔一个月，第三针跟第二针隔半年。